MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015574	TAT	2	6	282785	282790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986490
4502	NC_015574	TCA	2	6	282823	282828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986490
4503	NC_015574	ATG	2	6	282831	282836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986490
4504	NC_015574	TGT	2	6	282848	282853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986490
4505	NC_015574	TAA	2	6	282970	282975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986490
4506	NC_015574	TAC	2	6	282976	282981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986490
4507	NC_015574	ATA	2	6	283005	283010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986490
4508	NC_015574	A	6	6	283240	283245	100 %	0 %	0 %	0 %	333986491
4509	NC_015574	T	6	6	283302	283307	0 %	100 %	0 %	0 %	333986491
4510	NC_015574	TTG	2	6	283334	283339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986491
4511	NC_015574	GAA	2	6	283372	283377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986491
4512	NC_015574	ACCCAC	2	12	283426	283437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986491
4513	NC_015574	TGC	2	6	283455	283460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986491
4514	NC_015574	AAT	2	6	283488	283493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986491
4515	NC_015574	TCA	2	6	283559	283564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986491
4516	NC_015574	TCA	2	6	283571	283576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986491
4517	NC_015574	TGG	2	6	283637	283642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986491
4518	NC_015574	CAT	2	6	283683	283688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986491
4519	NC_015574	TGA	3	9	283731	283739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986491
4520	NC_015574	TCC	2	6	283791	283796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986491
4521	NC_015574	GAT	2	6	283804	283809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986491
4522	NC_015574	AAAG	2	8	283927	283934	75 %	0 %	25 %	0 %	333986491
4523	NC_015574	TCT	2	6	283991	283996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986492
4524	NC_015574	AT	3	6	284007	284012	50 %	50 %	0 %	0 %	333986492
4525	NC_015574	TCC	2	6	284046	284051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986492
4526	NC_015574	GCA	2	6	284087	284092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986492
4527	NC_015574	TAC	2	6	284158	284163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986492
4528	NC_015574	AAAGG	2	10	284165	284174	60 %	0 %	40 %	0 %	333986492
4529	NC_015574	CAT	2	6	284182	284187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986492
4530	NC_015574	TTA	2	6	284243	284248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986492
4531	NC_015574	GGT	2	6	284314	284319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986492
4532	NC_015574	TTTAT	2	10	284409	284418	20 %	80 %	0 %	0 %	333986493
4533	NC_015574	T	7	7	284418	284424	0 %	100 %	0 %	0 %	333986493
4534	NC_015574	AGAA	2	8	284554	284561	75 %	0 %	25 %	0 %	333986493
4535	NC_015574	TG	3	6	284603	284608	0 %	50 %	50 %	0 %	333986493
4536	NC_015574	ATG	2	6	284660	284665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986493
4537	NC_015574	GTAA	2	8	284723	284730	50 %	25 %	25 %	0 %	333986493
4538	NC_015574	T	8	8	284831	284838	0 %	100 %	0 %	0 %	333986493
4539	NC_015574	TCC	2	6	284859	284864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986493
4540	NC_015574	ATC	2	6	284882	284887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986493
4541	NC_015574	CAA	2	6	284910	284915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986493
4542	NC_015574	AAG	2	6	285001	285006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986493
4543	NC_015574	CAG	2	6	285120	285125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986493
4544	NC_015574	GAA	2	6	285184	285189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986493
4545	NC_015574	ATA	2	6	285203	285208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986493
4546	NC_015574	CTC	2	6	285256	285261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986493
4547	NC_015574	CCCAT	2	10	285333	285342	20 %	20 %	0 %	60 %	333986493
4548	NC_015574	TTG	2	6	285366	285371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986493
4549	NC_015574	TAT	2	6	285394	285399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986493
4550	NC_015574	CT	3	6	285426	285431	0 %	50 %	0 %	50 %	333986493
4551	NC_015574	TCC	2	6	285487	285492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986493
4552	NC_015574	ATT	2	6	285802	285807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986493
4553	NC_015574	T	6	6	285971	285976	0 %	100 %	0 %	0 %	333986494
4554	NC_015574	AGA	2	6	285992	285997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986494
4555	NC_015574	CTT	2	6	286107	286112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986494
4556	NC_015574	TTCT	2	8	286127	286134	0 %	75 %	0 %	25 %	333986494
4557	NC_015574	GCC	2	6	286165	286170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986494
4558	NC_015574	TGG	2	6	286181	286186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986494
4559	NC_015574	ATG	2	6	286284	286289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986494
4560	NC_015574	CTT	2	6	286334	286339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986494
4561	NC_015574	TGTT	2	8	286345	286352	0 %	75 %	25 %	0 %	333986494
4562	NC_015574	TAACG	2	10	286692	286701	40 %	20 %	20 %	20 %	333986495
4563	NC_015574	T	6	6	286747	286752	0 %	100 %	0 %	0 %	333986495
4564	NC_015574	ATT	2	6	286785	286790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986495
4565	NC_015574	TTTCCA	2	12	286843	286854	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333986495
4566	NC_015574	ATT	2	6	286902	286907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986495
4567	NC_015574	GTT	2	6	286953	286958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986495
4568	NC_015574	ACT	2	6	286984	286989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986495
4569	NC_015574	T	7	7	287021	287027	0 %	100 %	0 %	0 %	333986495
4570	NC_015574	A	8	8	287326	287333	100 %	0 %	0 %	0 %	333986496
4571	NC_015574	TTA	2	6	287370	287375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986496
4572	NC_015574	GTA	2	6	287459	287464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986496
4573	NC_015574	ATA	2	6	287471	287476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986496
4574	NC_015574	A	7	7	287714	287720	100 %	0 %	0 %	0 %	333986496
4575	NC_015574	ACC	2	6	287800	287805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986496
4576	NC_015574	A	6	6	288007	288012	100 %	0 %	0 %	0 %	333986497
4577	NC_015574	CGA	2	6	288017	288022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986497
4578	NC_015574	ACTT	2	8	288141	288148	25 %	50 %	0 %	25 %	333986497
4579	NC_015574	CAG	2	6	288219	288224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986497
4580	NC_015574	GCA	2	6	288270	288275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986497
4581	NC_015574	AGTTT	2	10	288393	288402	20 %	60 %	20 %	0 %	333986497
4582	NC_015574	AGAA	2	8	288775	288782	75 %	0 %	25 %	0 %	333986498
4583	NC_015574	GAG	2	6	288817	288822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986498
4584	NC_015574	ACC	2	6	288885	288890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986498
4585	NC_015574	AT	3	6	288898	288903	50 %	50 %	0 %	0 %	333986498
4586	NC_015574	ACC	2	6	288924	288929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986498
4587	NC_015574	AAGGT	2	10	288983	288992	40 %	20 %	40 %	0 %	333986498
4588	NC_015574	A	8	8	288999	289006	100 %	0 %	0 %	0 %	333986498
4589	NC_015574	AGT	2	6	289029	289034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986498
4590	NC_015574	GAAG	2	8	289095	289102	50 %	0 %	50 %	0 %	333986498
4591	NC_015574	GGT	2	6	289110	289115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986498
4592	NC_015574	TGT	2	6	289194	289199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986498
4593	NC_015574	A	6	6	289201	289206	100 %	0 %	0 %	0 %	333986498
4594	NC_015574	GTT	2	6	289211	289216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986498
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4596	NC_015574	AAC	2	6	289456	289461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986499
4597	NC_015574	ATC	2	6	289508	289513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986499
4598	NC_015574	ACA	2	6	289514	289519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986499
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4600	NC_015574	AT	3	6	289609	289614	50 %	50 %	0 %	0 %	333986499
4601	NC_015574	AG	3	6	289707	289712	50 %	0 %	50 %	0 %	333986500
4602	NC_015574	ATGT	2	8	289715	289722	25 %	50 %	25 %	0 %	333986500
4603	NC_015574	GTCT	2	8	289756	289763	0 %	50 %	25 %	25 %	333986500
4604	NC_015574	AAG	2	6	289857	289862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986500
4605	NC_015574	CCAT	2	8	289907	289914	25 %	25 %	0 %	50 %	333986500
4606	NC_015574	CTT	2	6	289932	289937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986500
4607	NC_015574	CTG	2	6	290040	290045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986500
4608	NC_015574	TC	3	6	290256	290261	0 %	50 %	0 %	50 %	333986500
4609	NC_015574	CCT	2	6	290310	290315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986500
4610	NC_015574	CTT	2	6	290350	290355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986500
4611	NC_015574	T	6	6	290423	290428	0 %	100 %	0 %	0 %	333986500
4612	NC_015574	CTA	2	6	290530	290535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986501
4613	NC_015574	TGG	2	6	290552	290557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986501
4614	NC_015574	GCCAC	2	10	290631	290640	20 %	0 %	20 %	60 %	333986501
4615	NC_015574	CAA	2	6	290653	290658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986501
4616	NC_015574	CA	4	8	290668	290675	50 %	0 %	0 %	50 %	333986501
4617	NC_015574	AAT	2	6	290689	290694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986501
4618	NC_015574	TG	3	6	290733	290738	0 %	50 %	50 %	0 %	333986501
4619	NC_015574	AAGAAC	2	12	290762	290773	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333986501
4620	NC_015574	CAG	2	6	290878	290883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986501
4621	NC_015574	TGC	2	6	290911	290916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986501
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